在办理商品房买卖合同公证时，申请公证双方需要向公证机关提交相关的资料，这些资料包括，出售方：企业营业执照(居民身份证)、房屋所有权证或土地使用证、商品房销售许可证及买卖房屋合同文本。购买方：居民身份证、户口簿或法人资格证书。
房屋买卖双方在办理合同公证时，公证机关一般要向双方当事人了解以下情况：
买卖双方当事人基本情况;
房屋状况;
双方当事人对买卖合同内容是否认同，是否协商一致以及法律后果是否明确。
在提交了所需材料之后，公证机关除去要对所提交材料是否齐备、属实进行审核之外，主要对合同的下述内容进行审核：当事人双方的基本情况;合同中买卖房屋的坐落位置、数量、房屋结构、质量及附属设施情况和使用面积;房屋买卖价款数额、付款日期、付款方式;被买卖房屋交付使用时间;办理房屋产权过户及有关手续的约定;双方违约责任;双方当事人认为应当约定的其它内容;合同双方当事人签字、盖章及签约时间等。
公证机关工作人员对审查内容审核之后，将符合公证条件的公证事项填写审批表，正式办理合同公证手续。
另外在办理商品房买卖合同公证时，购房一方应注意以下一些问题：首先房屋买卖合同应经过房地产交易所核定;其次商品房开发销售手续不健全的房屋，一般不予公证;办理合同公证应尽量委托自己的代为办理，这样无论从专业的角度，还是从操作便利的角度看，对购房人都会更加有利。
