1、民事法律关系及所适用的法律不同。
货物运输保险是一种独立的民事法律关系，作为主体的当事人分为投保人、保险人和受益人。而保价运输不是独立的民事法律关系，它是货物运输合同的条款，作为主体是合同中的托运人、承运人和收货人。保险运输受保险法律、法规的调整，适用有关保险方面的规定。保价运输受运输法律、法规的调整，适用有关运输规程的规定。
2、作用不同。
保险运输它可以使投保人在出现保险责任范围内的损失时，可以从保险公司得到保险金额内的赔偿，挽回经济损失。而保价运输是在履行合同中，由于承运人的过错造成货物损失时，托运人或收货人可以按声明价格得到赔偿。
3、保期不同。
保险运输的责任，从保险货物起运地点的仓库或储存处所时开始，直至目的地收货人的仓库或储存处所时终止。保价期限一般是从承运人承运货物的次日起算，直至到站由承运人组织卸车的货物，到卸完为止。
4、索赔时效不同。
保险运输投保人向保险人索赔时效，从被保险人保险财产遭受损失的当天起算，请求时效为两年。保价运输权利人向承运人索赔时效，从承运人交给托运人或收货人货运记录的次日起算，要求赔偿或退补费用有效期为一百八十日。
