双方当事人在规定的时间内分别陈述意见和理由。陈述顺序先患方，后医疗机构;专家鉴定组成员根据需要可以提问，当事人应当如实回答。必要时，可以对患者进行现场医学检查;双方当事人退场。住院患者的病程记录、死亡病例讨论记录、疑难病例讨论记录、会诊意见、上级医师查房记录等病历资料原件。
第一、在受理阶段，当事人双方可在人民法院或卫生行政机关主持下选定鉴定委员会委员，组成鉴定委员会，由主持人公布鉴定委员会组成人员名单，当事人可提出回避申请，由有权机关作出是否回避的决定;
第二、在调查阶段，当事人提供相关的申请书、病历等证据。鉴定委员会一般应口头调查，并应公开进行。目前的鉴定程序都是书面调查，这样不利于查清事实，也不利于提供证据和充分地辩论。整个过程及内容由记录人记录在卷，双方当事人及委托代理人签名、盖章;
第三、在作出鉴定结论阶段，鉴定委员会评议应不公开进行。由鉴定主持人负责鉴定书的的制作。
鉴定结论的内容及形式只有全面、客观地反映出鉴定的全貌，才有可能使当事人、法官、行政官员判断出鉴定结论的正确性。
因此，鉴定书应该载明当事人以及委托代理人情况，鉴定委员会委员的基本情况，申请鉴定理由以及请求，双方当事人向行政机关或法院提供的证据，双方当事人及其代理人对此事的定性及依据，鉴定委员会的分析意见，对证据及当事人双方及代理人意见的分析论证，鉴定结论，鉴定委员会签名、日期。
在分析意见中，鉴定结论应写明病情、结论，医方是否存在过失行为以及过失行为与病情有无因果关系，鉴定委员会委员应分别说明自己的意见;应写明事件性质和事故等级。
医疗事故鉴定要按照一定的程序进行，只有符合程序的鉴定才能作为对发生医疗事故的医疗机构和医务人员作出行政处理以及进行医疗事故赔偿调解的依据。另外，为保护专家和医患双方的利益，医疗事故鉴定过程一般不准许旁听。
在我国的医疗事故的鉴定程序中。医疗事故的当事人可委托医学专家或律师出席，当事人及其代理人提供证据，进行质证和辩论;鉴定委员会以中立第三者的身份，听取双方意见，并对双方所提供材料的合法性、真实性、合理性进行审查，决定是否采纳。
