一、传染病菌种、毒种扩散罪最新立案标准是什么
1、传染病菌种、毒种扩散罪最新立案标准为：
(1)、导致甲类和按甲类管理的传染病传播的；
(2)、导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
(3)、造成人员重伤或者死亡的；
(4)、严重影响正常的生产、生活秩序的；
(5)、其他造成严重后果的情形。
2、法律依据：
根据《中华人民共和国刑法》第三百三十一条规定
从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
二、传染病菌种、毒种扩散罪与危险物品肇事罪的区分
危险物品肇事罪，是指违反爆炸性、易燃性、放射性、毒害性、腐蚀性物品的管理规定，在生产、储存、运输、使用中发生重大事故，造成严重后果的行为。
区别：
第一，二者侵害的主要客体不同。本罪侵害的主要客体是国家关于传染病防治的管理制度；而后者侵害的主要客体则是公共安全。
第二，犯罪对象的性质不同。作为危险物品肇事罪的犯罪对象之一毒害性物品应是指敌敌畏、敌百虫、砒霜、氰化钾、氰化钠、氧化乐甲等无机物，强调的是其剧毒性；而传染病菌种、毒种属有机物，其主要特点是传染性，两者存在显著差异。
第三，犯罪主体不同。前者的犯罪主体是特殊主体，即只限于从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员；后者的犯罪主体是一般主体，任何具备刑事责任能力的自然人均可构成该罪。
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