如果是员工与用人单位之间因为保密协议书产生的纠纷，属于劳动仲裁范围，应先申请劳动仲裁，对仲裁不服才能去法院起诉。如果是企业与企业之间、或者企业与非员工之间，因为保密协议书之间产生的纠纷，不属于劳动仲裁范围，属于一般的民事纠纷，直接向法院起诉，劳动仲裁不受理。
保密协议的争议如何解决
保密协议中主要是劳动者单方保守用人单位的商业秘密的义务。《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的第4条规定：“发生劳动争议，劳动者可以与用人单位协商，也可以请工会或者第三方共同与用人单位协商，达成和解协议。”第4条规定：“发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。”
劳动和社会保障部办公厅《关于劳动争议案中涉及商业秘密侵权问题的函》(劳社厅函〔1999〕69号)“劳动合同中如果明确约定了有关保守商业秘密的内容，由于劳动者未履行，造成用人单位商业秘密被侵害而发生劳动争议，当事人向劳动争议仲裁委员会申请仲裁的，仲裁委员会应当受理，并依据有关规定和劳动合同的约定作出裁决。”
如果保密协议作为劳动合同的一部分，则属于劳动争议的范围，需要劳动仲裁前置程序。如果企业与劳动者以自愿为前提在劳动合同外，单独签订劳动合同则可以依据当事人的约定的解决方式，不必先经劳动仲裁。
我国刑法也为保护商业秘密提供了救济途径。《刑法》第219条的规定：“有下列侵犯商业秘密行为之一，给商业秘密的权利人造成重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金;造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金：(一)以盗窃、利诱、胁迫或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密的;(二)披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密的;(三)违反约定或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密的。明知或者应知前款所列行为，获取、使用或者披露他人的商业秘密的，以侵犯商业秘密论。本条所称商业秘密，是指不为公众所知悉，能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。本条所称权利人，是指商业秘密的所有人和经商业秘密所有人许可的商业秘密使用人。”
最高人民检察院、公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》第73条的规定：“[侵犯商业秘密案(刑法第二百一十九条)]侵犯商业秘密，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：(一)给商业秘密权利人造成损失数额在五十万元以上的;(二)因侵犯商业秘密违法所得数额在五十万元以上的;(三)致使商业秘密权利人破产的;(四)其他给商业秘密权利人造成重大损失的情形。”
以上就是小编为您整理的内容，保密协议是否适用劳动仲裁，需要根据具体情况来确定，如果是劳动者与用人单位之间的保密协议，这属于劳动争议，是可以适用劳动仲裁的。如果你情况比较复杂，衡阳律师网www.fenxiangshe.cn也提供律师在线咨询服务，欢迎您进行法律咨询。
